時間發生在奧特曼離開地球的50年後，人們終於迎來久違的和平，地球防衛軍也因此完成了使命而成立了shine（地球和平聯合組織），人類迎來了新的時代，但事實真是如此嗎？如那年梅特龍星人說得那樣“地球遲早會毀滅的”，一道藍色的災厄之光打破了片刻的和平，未知巨獸席捲而來！在人們的幸福即將被奪走之時，名為趙英時的人類與另一束紅色光芒相遇了.....